至于Android和iOS的开发环境差异，那是客户端的事情，和后台没啥关系。Java做的APP后台可以同时给安卓和iOS用，本质上就是处理APP提交的数据，存数据库或者查询后返回结果。后台开发不用考虑前端用哪个系统，只管数据交互就行。
可以用Java做手机端后台吗？
另一个区别是登录验证和数据加密机制不同。Web端通常用Session保持登录状态，而APP开发更多采用Token验证方式。Token是根据用户ID生成的加密字符串，后台接收后通过数据库查询用户信息。如果对安全性要求高，APP传输的数据可能需要额外加密处理，而Web端一般用HTTPS就够了。
Java后台开发手机应用的话，核心和Web后台其实差不多。比如用SSH框架照样能给APP做接口，主要区别在于数据传输格式。Web端一般返回HTML页面或者少量JSON，但APP后台基本都是直接传JSON数据，当然有些项目也会用其他格式，不过JSON算是主流了。