在移动硬盘里直接运行程序会损坏硬盘吗

你看到的文件夹可能是系统自动生成的，建议打开工具栏的查看选项并显示文件扩展名，检查这两个文件夹的后缀是否一致。正常情况下同名文件无法共存，若其中一个后缀为.exe，很可能是病毒伪装成文件夹，直接删除该exe文件并全盘杀毒即可。