显微镜的光学元件清洁需要极度的细致与规范，直接用手擦拭是大忌。手指上难免会残留油脂、汗液以及微小的皮屑，这些物质一旦沾染到镜头表面，不仅难以清理，还会形成顽固的油膜，严重阻碍光线的透过，导致成像质量急剧下降，甚至可能因为后续用力擦拭而划伤娇贵的光学镜片。
为什么不能用手直接擦拭显微镜？
显微镜的工作环境湿度控制同样关键，长期处于高湿环境易诱发光学元件霉变。若必须在潮湿环境中使用，建议配备去湿机。一旦发现镜头出现雾状或霉斑迹象，应立即停止自行处理并联系专业人员进行维护保养，切勿盲目擦拭以免扩大损坏范围。
在使用100倍油镜完毕后，必须立即将镜头表面的香柏油擦拭干净，并仔细检查40倍物镜是否意外沾上油滴，防止油污固化影响后续观察。同时，显微镜外壳若需清洁，仅限使用乙醇或肥皂水，严禁使用其他有机溶剂，且要防止液体渗入内部导致电子部件短路或烧毁。
特别是高倍物镜，其前组镜头往往具有较小的曲率半径凹面，结构精密。擦拭时需使用带有棉球的牙签或棉签，动作要轻，确保棉签能触及凹面内部，且绝对禁止用力刮擦。擦拭后务必用放大镜检查是否有损伤，若有手指印残留，需按标准方法重新清洁以恢复清晰度。
为了保证显微镜的光学性能，当仪器闲置时务必盖上防尘罩。如果表面有灰尘，应先用吹气球吹走或用柔软毛刷轻轻拂去，切忌直接上手。清洁光学表面时，应选用无绒棉布、专用镜头纸或蘸取少量专用清洁液的棉签，溶剂使用量要控制得当，避免渗入内部损坏元件。